Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms