Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf4Q64287 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf4Q64287 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf4Q64287 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf4Q64287 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf4Q64287 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf4Q64287 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf4Q64287 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf4Q64287 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irf4Q64287 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irf4Q64287 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irf4Q64287 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Irf4Q64287 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Irf4Q64287 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irf4Q64287 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irf4Q64287 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf4Q64287 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf4Q64287 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms