Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms