Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ss18Q62280 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ss18Q62280 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ss18Q62280 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ss18Q62280 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ss18Q62280 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ss18Q62280 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ss18Q62280 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ss18Q62280 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ss18Q62280 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ss18Q62280 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ss18Q62280 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ss18Q62280 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ss18Q62280 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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