Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SypQ62277 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SypQ62277 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SypQ62277 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SypQ62277 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SypQ62277 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SypQ62277 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SypQ62277 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SypQ62277 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SypQ62277 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SypQ62277 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SypQ62277 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms