Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Six3Q62233 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Six3Q62233 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Six3Q62233 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Six3Q62233 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Six3Q62233 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Six3Q62233 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Six3Q62233 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Six3Q62233 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Six3Q62233 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Six3Q62233 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Six3Q62233 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Six3Q62233 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Six3Q62233 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Six3Q62233 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Six3Q62233 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Six3Q62233 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Six3Q62233 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Six3Q62233 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Six3Q62233 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Six3Q62233 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Six3Q62233 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Six3Q62233 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six3Q62233 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Six3Q62233 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Six3Q62233 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Six3Q62233 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Six3Q62233 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Six3Q62233 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Six3Q62233 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Six3Q62233 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Six3Q62233 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms