Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ttf1Q62187 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ttf1Q62187 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Ttf1Q62187 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Ttf1Q62187 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Ttf1Q62187 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Ttf1Q62187 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Ttf1Q62187 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Ttf1Q62187 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Ttf1Q62187 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Ttf1Q62187 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Ttf1Q62187 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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