Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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