Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms