Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Prkd1Q62101 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Prkd1Q62101 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Prkd1Q62101 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Prkd1Q62101 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Prkd1Q62101 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Prkd1Q62101 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms