Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms