Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga7Q61738 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms