Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EsrrbQ61539 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms