Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfap2bQ61313 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms