Protein–RNA interactions for Protein: Q61183

Papola, Poly(A) polymerase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolaQ61183 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolaQ61183 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms