Protein–RNA interactions for Protein: Q61147

Cp, Ceruloplasmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpQ61147 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CpQ61147 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CpQ61147 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CpQ61147 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CpQ61147 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CpQ61147 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CpQ61147 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CpQ61147 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CpQ61147 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CpQ61147 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CpQ61147 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CpQ61147 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CpQ61147 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CpQ61147 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CpQ61147 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CpQ61147 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CpQ61147 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CpQ61147 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CpQ61147 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CpQ61147 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CpQ61147 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CpQ61147 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CpQ61147 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CpQ61147 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CpQ61147 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CpQ61147 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CpQ61147 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CpQ61147 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CpQ61147 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CpQ61147 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CpQ61147 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CpQ61147 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CpQ61147 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CpQ61147 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CpQ61147 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CpQ61147 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CpQ61147 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CpQ61147 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CpQ61147 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CpQ61147 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CpQ61147 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CpQ61147 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CpQ61147 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CpQ61147 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms