Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
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Trpc6Q61143 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Trpc6Q61143 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Trpc6Q61143 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Trpc6Q61143 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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Trpc6Q61143 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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Trpc6Q61143 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Trpc6Q61143 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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