Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usf1Q61069 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usf1Q61069 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usf1Q61069 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usf1Q61069 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usf1Q61069 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usf1Q61069 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usf1Q61069 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usf1Q61069 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usf1Q61069 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Usf1Q61069 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usf1Q61069 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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