Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms