Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms