Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms