Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms