Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms