Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Arcn1Q5XJY5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Arcn1Q5XJY5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Arcn1Q5XJY5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Arcn1Q5XJY5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Arcn1Q5XJY5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Arcn1Q5XJY5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Arcn1Q5XJY5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Arcn1Q5XJY5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arcn1Q5XJY5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Arcn1Q5XJY5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arcn1Q5XJY5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arcn1Q5XJY5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arcn1Q5XJY5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Arcn1Q5XJY5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Arcn1Q5XJY5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arcn1Q5XJY5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arcn1Q5XJY5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arcn1Q5XJY5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arcn1Q5XJY5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arcn1Q5XJY5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms