Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Brip1Q5SXJ3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms