Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsr1Q5SWD9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms