Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc42Q5SV66 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms