Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap44Q5SSM3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap44Q5SSM3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms