Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PkdccQ5RJI4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PkdccQ5RJI4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PkdccQ5RJI4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PkdccQ5RJI4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PkdccQ5RJI4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PkdccQ5RJI4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PkdccQ5RJI4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PkdccQ5RJI4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PkdccQ5RJI4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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