Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms