Protein–RNA interactions for Protein: Q5QNQ9

Col27a1, Collagen alpha-1(XXVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col27a1Q5QNQ9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms