Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms