Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms