Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf3Q5HZG4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms