Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms