Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms