Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms