Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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