Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig2Q52KR2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms