Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl6Q505G4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rtl6Q505G4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rtl6Q505G4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rtl6Q505G4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rtl6Q505G4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rtl6Q505G4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rtl6Q505G4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rtl6Q505G4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rtl6Q505G4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rtl6Q505G4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rtl6Q505G4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rtl6Q505G4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rtl6Q505G4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rtl6Q505G4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rtl6Q505G4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl6Q505G4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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