Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc47Q505F5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc47Q505F5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc47Q505F5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc47Q505F5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc47Q505F5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc47Q505F5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc47Q505F5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc47Q505F5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc47Q505F5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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