Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms