Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms