Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms