Protein–RNA interactions for Protein: Q497J0

BC100530, MCG130175, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC100530Q497J0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
BC100530Q497J0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
BC100530Q497J0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms