Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa20Q45VN2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms