Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms