Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Ccdc185Q3V118 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc185Q3V118 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc185Q3V118 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Ccdc185Q3V118 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Ccdc185Q3V118 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Ccdc185Q3V118 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc185Q3V118 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ccdc185Q3V118 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ccdc185Q3V118 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ccdc185Q3V118 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc185Q3V118 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ccdc185Q3V118 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ccdc185Q3V118 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc185Q3V118 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc185Q3V118 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc185Q3V118 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ccdc185Q3V118 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc185Q3V118 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc185Q3V118 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc185Q3V118 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ccdc185Q3V118 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ccdc185Q3V118 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc185Q3V118 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc185Q3V118 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc185Q3V118 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc185Q3V118 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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