Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Rbm44Q3V089 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Rbm44Q3V089 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Rbm44Q3V089 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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Rbm44Q3V089 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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Rbm44Q3V089 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Rbm44Q3V089 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Rbm44Q3V089 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Rbm44Q3V089 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Rbm44Q3V089 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbm44Q3V089 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms