Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnpc3Q3UZ01 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms